Obsah

• Soubor TypeCompressed Alignment File
• Binární
• Co je soubor CRAM?
• O souborech CRAM

Soubor TypeCompressed Alignment File

Vývojář	EBI
Popularita	3,0 (1 hlas)
Kategorie	Datové soubory
Formát	Binární X Binární Tento soubor je uložen v binárním formátu, který vyžaduje přečtení jeho obsahu.

Co je soubor CRAM?

Formát souboru komprimovaného zarovnání vytvořený EBI, zastoupení Evropské laboratoře molekulární biologie; ukládá krátké zarovnání sekvencí DNA vytvořené z aligátorů s krátkým čtením, jako jsou BWA, BBMap a BLAT. Více informací

Formát souboru CRAM je podobný formátu souborů BAM (Binary Alignment / Map (BAM)), ale nabízí lepší komprimaci souborů a restrukturalizovaný formát binárních kontejnerů orientovaný na sloupec. Jak se objemy dat zvětšují v poli genetického softwaru, formát CRAM byl navržen tak, aby se zmenšilo vytisknutí dat zarovnání na disk.

Zarovnání krátkého čtení je proces dešifrování, kde sekvence pochází z genomu. To může být obtížné, protože referenční genom je poměrně velký a ne vždy hledáte přesné shody v referenčním genomu. Zkratky s krátkým čtením se používají k vyhledávání enormních sekvencí pro shody a shody. Protože sekvence jsou tak velké, komprese poskytovaná formáty jako CRAM je nezbytná pro udržení spravovatelnosti velikosti souborů.

ZDARMA DOWNLOAD Získejte Prohlížeč souborů pro Android programy, které otevírají soubory CRAM

Okna

Samtools

Aktualizováno 1.11.2016

O souborech CRAM

Naším cílem je pomoci vám pochopit, co je soubor s příponou * .cram a jak jej otevřít.

Typ souboru komprimovaného zarovnání, popis formátu souboru a programy systému Windows uvedené na této stránce byly individuálně prozkoumány a ověřeny týmem FileInfo. Usilujeme o 100% přesnost a publikujeme pouze informace o formátech souborů, které jsme testovali a ověřili.

Chcete-li na této stránce navrhnout jakékoli doplňky nebo aktualizace, dejte nám prosím vědět.